MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D153

Total Repeats: 8072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021743	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021743	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021743	ACA	2	6	1262	1267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021743	ACTGAA	2	12	1340	1351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021743	ACC	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021743	T	6	6	2694	2699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021743	ATT	2	6	3653	3658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021743	T	6	6	4192	4197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021743	GATATA	2	12	4232	4243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021743	AATA	2	8	4246	4253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021743	TAA	2	6	4266	4271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021743	TA	3	6	4279	4284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021743	TCAT	2	8	4295	4302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021743	AT	4	8	4348	4355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021743	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021743	A	6	6	4415	4420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021743	AG	3	6	4436	4441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021743	T	6	6	4442	4447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021743	A	6	6	4503	4508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021743	CTTT	2	8	4626	4633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021743	CAT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021743	CTA	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021743	T	9	9	6693	6701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021743	ACA	2	6	6740	6745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021743	ACC	2	6	6799	6804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021743	A	6	6	8503	8508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021743	AGA	2	6	8562	8567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021743	AATC	2	8	8633	8640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021743	CTTT	2	8	9824	9831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021743	TTC	2	6	9840	9845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021743	AGT	2	6	9859	9864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021743	CT	3	6	9891	9896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021743	CTAT	2	8	9918	9925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021743	TAG	2	6	11650	11655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021743	AGA	2	6	11717	11722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021743	AATC	2	8	11788	11795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021743	GACA	2	8	12860	12867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021743	TCT	2	6	12906	12911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021743	TA	3	6	12956	12961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021743	A	6	6	13025	13030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021743	TGCC	2	8	13127	13134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021743	CAA	2	6	13182	13187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021743	TTA	2	6	13197	13202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021743	T	6	6	13215	13220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021743	GAT	2	6	13235	13240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021743	T	6	6	14819	14824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021743	AG	3	6	14886	14891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021743	A	7	7	14902	14908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021743	A	6	6	14945	14950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021743	T	6	6	14955	14960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021743	A	6	6	14977	14982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021743	CGGA	2	8	15040	15047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021743	GTA	2	6	15080	15085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021743	CCG	2	6	15138	15143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_021743	CAC	2	6	15179	15184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021743	TAT	2	6	15222	15227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021743	AAT	2	6	15312	15317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021743	TTA	2	6	15337	15342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021743	ATTA	2	8	15363	15370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021743	ATTA	2	8	15372	15379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021743	TTA	2	6	15391	15396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021743	TAT	2	6	15412	15417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021743	A	6	6	16100	16105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021743	TTA	2	6	16124	16129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021743	AAATT	2	10	20885	20894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021743	GTT	2	6	20946	20951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021743	CAAATA	2	12	20968	20979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021743	ATTTT	2	10	20988	20997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021743	TAC	2	6	21028	21033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021743	TAG	2	6	21036	21041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021743	TG	3	6	21048	21053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021743	TAA	2	6	21067	21072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021743	A	6	6	22826	22831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021743	ATA	2	6	22869	22874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021743	AGG	2	6	22883	22888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021743	GTT	2	6	23250	23255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021743	A	7	7	25259	25265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021743	TTG	2	6	25283	25288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021743	AAT	2	6	28268	28273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021743	A	6	6	30746	30751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021743	ACT	2	6	30786	30791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021743	CTAT	2	8	31899	31906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021743	TA	3	6	31986	31991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021743	ATA	2	6	32014	32019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021743	AG	3	6	32052	32057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021743	TTG	2	6	32072	32077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021743	T	6	6	32089	32094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021743	CAAA	3	12	32120	32131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021743	TTAT	2	8	32148	32155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021743	GAA	2	6	32179	32184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021743	CT	3	6	34856	34861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021743	GA	4	8	34872	34879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021743	AG	3	6	34911	34916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021743	TCT	2	6	34983	34988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021743	TCCC	2	8	35005	35012	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_021743	AAG	2	6	35035	35040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021743	CTC	2	6	36971	36976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021743	A	6	6	36979	36984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021743	ATT	2	6	37047	37052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021743	TGAT	2	8	37070	37077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021743	CT	3	6	37080	37085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021743	G	7	7	37134	37140	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021743	ATT	2	6	38589	38594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021743	A	6	6	38603	38608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021743	T	6	6	38630	38635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021743	ATT	2	6	38654	38659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021743	AAACT	2	10	38664	38673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021743	T	8	8	38687	38694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021743	TGT	2	6	38776	38781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021743	TTAT	2	8	39707	39714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021743	T	6	6	39734	39739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021743	AAT	2	6	39772	39777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021743	A	6	6	39805	39810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021743	ATT	2	6	39863	39868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021743	GTTTT	2	10	41153	41162	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021743	AT	3	6	41165	41170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021743	ATA	2	6	41232	41237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021743	TGTT	2	8	42746	42753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021743	TAT	2	6	42763	42768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021743	TC	3	6	42824	42829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021743	ATTAA	2	10	42857	42866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021743	ATTA	2	8	43589	43596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021743	ATA	2	6	43600	43605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021743	TTA	2	6	43653	43658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021743	AATT	2	8	43669	43676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021743	AGA	2	6	43682	43687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021743	CAAG	2	8	44323	44330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021743	T	6	6	44337	44342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021743	A	7	7	44356	44362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021743	T	6	6	44401	44406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021743	CAG	2	6	44410	44415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021743	AAG	2	6	46410	46415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021743	T	7	7	46457	46463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021743	CT	3	6	46485	46490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021743	T	7	7	46537	46543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021743	A	6	6	47890	47895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021743	T	7	7	47915	47921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021743	TA	3	6	47950	47955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021743	AG	3	6	47956	47961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021743	T	6	6	47965	47970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021743	T	6	6	48005	48010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021743	TTTC	2	8	48048	48055	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021743	A	6	6	48066	48071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021743	TAC	2	6	48097	48102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021743	AAT	2	6	48126	48131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021743	A	6	6	50586	50591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021743	GAA	2	6	51267	51272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021743	ATA	2	6	53279	53284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021743	CTT	2	6	53295	53300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021743	AAATT	2	10	53348	53357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021743	GTTT	2	8	53376	53383	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_021743	TGG	2	6	135576	135581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_021743	TTA	2	6	135955	135960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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